Кроме органов исполнительной, законодательной и судебной власти существует также ряд независимых органов государственного управления, которые выполняют свои соответствующие функции.

Конституционный Суд имеет право рассматривать вопросы о соответствии отдельных законов Конституции Республики Корея, делать заключение об аппеляции в отношении импичмента высокопоставленного чиновника и принимать решение о роспуске политической партии в соответствии с Конституцией страны. Конституционный Суд состоит из девяти судей, из которых по три судьи назначают Президент, Национальное Собрание и председатель Верховного Суда. Председателя Конституционного Суда назначает Президент с согласия Национального Собрания.

Национальная избирательная комиссия рассматривает вопросы, связанные с выборами, справедливым управлением референдумами, политическими партиями и политическими фондами. Члены комиссии избираются на 6 лет, и им не разрешается вступать в политические партии или заниматься политической деятельностью. Председатель комиссии избирается из числа ее членов.

Корейская национальная комиссия по правам человека выполняет функции, связанные с обеспечением уважения и достоинства личности, реализацией общечеловеческих ценностей, защитой основных прав и свобод человека. Комиссия была создана в ноябре 2001 г. на волне искреннего стремления граждан улучшить положение дел с правами человека, выраженного в процессе демократизации. Комиссия также рассматривает дела, связанные с нарушением прав человека или дискриминацией в отношении иностранцев, постоянно проживающих или работающих в стране.